Multi Hypothesis Test Correction in Genome Wide Association Study

最简单的方法
$$
New \ P \ value = \frac{Old \ P \ value}{N}
$$
N是假设检验的个数,而不是比较的个数。

比如说,我有200组数据,第1组和第2组做t test,第3组和第4组做t test…,这样做了100次假设检验,但每组都只比了1次。那么N当然取100。


以上的做法是无法重复实验时的无奈之举。

如果可以重复实验,我推荐的做法是,把Old P value小于某一阈值的重新做实验,看新的P value是多少。


以下这种图的纵轴都是经过多重假设检验校正的

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